En 2003, Nadal participe à ses deux premiers tournois du Grand Chelem. Il atteint le troisième tour de Wimbledon pour sa première participation, ce que seul Boris Becker avait réussi par le passé. Il est sorti au deuxième tour à l'US Open.
En 2004, Nadal est sélectionné pour la première fois et participe avec l'équipe d'Espagne à la Coupe Davis où il gagne au premier tour contre Radek ¦těpánek lors d'Espagne-République tchèque (3-2), puis en demi-finale contre Arnaud Clément lors d'Espagne-France (4-1). En finale, face aux États-Unis, il remporte son match contre Andy Roddick lors du second match et l'Espagne l'emporte finalement 3 à 2. Nadal remporte son premier trophée majeur.
Il va jusqu'en finale à Auckland, qu'il perd face au Slovaque Dominik Hrbatý en trois manches. Il remporte également son premier tournoi majeur en simple à Sopot, sur terre battue, face à l'Argentin José Acasuso. Il devient, à 17 ans, le deuxième plus jeune joueur, après Michael Chang, à entrer dans le classement des 100 meilleurs joueurs mondiaux. Il est également le deuxième plus jeune joueur à remporter un tournoi de Masters Series, après Michael Chang.
C'est également en 2004 que Nadal affronte et bat pour la première fois Roger Federer, le numéro 1 mondial, au troisième tour du Masters de Miami. Rafael doit participer aux Internationaux de France mais une blessure l'empêche d'y prendre part. Il participe néanmoins à l'Open d'Australie et est éliminé par Lleyton Hewitt au troisueme tour et à l'US Open, il est éliminé au troisième tour par le meilleur serveur au monde: Andy Roddick
Il participe aux Jeux olympiques d'Athènes de 2004 en double avec Carlos Moyá où il perd au premier tour.
En 2004, Nadal est sélectionné pour la première fois et participe avec l'équipe d'Espagne à la Coupe Davis où il gagne au premier tour contre Radek ¦těpánek lors d'Espagne-République tchèque (3-2), puis en demi-finale contre Arnaud Clément lors d'Espagne-France (4-1). En finale, face aux États-Unis, il remporte son match contre Andy Roddick lors du second match et l'Espagne l'emporte finalement 3 à 2. Nadal remporte son premier trophée majeur.
Il va jusqu'en finale à Auckland, qu'il perd face au Slovaque Dominik Hrbatý en trois manches. Il remporte également son premier tournoi majeur en simple à Sopot, sur terre battue, face à l'Argentin José Acasuso. Il devient, à 17 ans, le deuxième plus jeune joueur, après Michael Chang, à entrer dans le classement des 100 meilleurs joueurs mondiaux. Il est également le deuxième plus jeune joueur à remporter un tournoi de Masters Series, après Michael Chang.
C'est également en 2004 que Nadal affronte et bat pour la première fois Roger Federer, le numéro 1 mondial, au troisième tour du Masters de Miami. Rafael doit participer aux Internationaux de France mais une blessure l'empêche d'y prendre part. Il participe néanmoins à l'Open d'Australie et est éliminé par Lleyton Hewitt au troisueme tour et à l'US Open, il est éliminé au troisième tour par le meilleur serveur au monde: Andy Roddick
Il participe aux Jeux olympiques d'Athènes de 2004 en double avec Carlos Moyá où il perd au premier tour.
